上海上藥杏靈科技藥業股份有限公司是上海市藥材有限公司旗下現代中藥與天然植物藥的研發、生產與銷售的高新技術企業。
上藥杏靈主導產品銀杏酮酯及其制劑、人工麝香原料藥（海可素I、海可素II），均為上海市高新技術成果轉化項目。其中，人工麝香原料藥（海可素I、海可素II）為國家中藥一類新藥，榮獲國家科學技術進步獎一等獎；銀杏酮酯為國家中藥二類新藥，其“銀杏酮酯成份分析”榮獲日內瓦國際發明展金獎，是公司完全擁有自主知識產權的專利產品。目前，公司擁有中、美、英、澳四國專利授權27項。
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上海雷允上藥業有限公司是上海市藥材有限公司旗下現代大型中藥企業，擁有中華老字號品牌，先后被評為上海市知識產權示范企業、上海市高新技術企業、上海市創新型企業。
公司品牌源于擁有近三百年歷史的“雷允上”，1860年自蘇州遷至上海并逐步發展壯大，民國期間已成為全國首屈一指的中成藥品牌。解放后逐步合并轉制為“上海雷允上藥業有限公司”，繼承了上海雷允上傳承百年的制藥精華和建國以來上海中藥制藥業的衣缽。
公司注重對優秀中藥瑰寶的傳承，堅持產品二次開發，提升品質。主要產品有國家保密產品六神丸，以及丹參片、珍菊降壓片、猴頭菌片、復方紫荊消傷巴布膏（原石氏傷膏）等一批知名產品。2011年，公司六神丸制作技藝被評為國家級非物質文化遺產，2016年，公司六神丸制作技藝傳承人榮獲上海醫藥系統企業唯一的首批“上海工匠”稱號。
公司擁有符合國家GMP規范的標準化中藥生產體系，常年生產丸劑、片劑、外用膏等8個劑型，50余個品規產品。2016年，公司完成工業集中，生產車間全部搬入占地200余畝的奉浦現代化中成藥生產基地。
踐行“責任、專業、合作、創新”的企業核心價值觀，上海雷允上藥業有限公司始終以完整而嚴格的質量保證體系確保產品質量，致力于打造值得消費者信賴的現代化大型優質中成藥品牌企業。
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上海上藥華宇藥業有限公司（以下簡稱“上藥華宇”）是上海市藥材有限公司旗下全資子公司，主要經營中藥材、中藥飲片，并具有野生動植物藥材經營資質，通過國家食品藥品監督管理局GSP認證。
上藥華宇擁有大型現代化倉儲設施，年吞吐30000余噸，經營的中藥材品種近1300種，各類中藥飲片1500余種。公司控股四家、托管二家中藥飲片生產企業，全部通過GMP認證。
上藥華宇多年來致力于中藥現代化發展，對中藥材種植、中藥飲片炮制進行深入研究，嚴格按標準化、規范化生產傳統中藥產品。公司在國內主要地道藥材產區建立質量可追溯、標準化中藥材生產種植基地和商品基地，全面保障中藥飲片質量的安全有效、穩定可控。2015年公司加快中藥產業鏈布局，成立了多家產地中藥資源公司。
上藥華宇致力于品牌建設，公司自2004年起連續獲得“高新技術企業”資質； 2005年起連續評為“上海市企業技術中心”稱號。
上藥華宇以“建立全品種、高品質、可追溯的中藥材與中藥飲片運營體系為基礎，拓展中藥材、中藥飲片市場為重點，培育技術領先和質量優勢的核心競爭力，成為全國行業領先企業”為企業發展愿景, 全力推進中藥產業的培育與發展。
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上海上藥神象健康藥業有限公司（以下簡稱上藥神象）是上海市藥材有限公司旗下專注于健康養生產品的專營品牌公司，主要經營野山參、冬蟲夏草、楓斗、西洋參、燕窩等名貴滋補品及其深加工產品。
上藥神象是上海中藥行業協會參茸專業委員會主任委員單位，“神象”牌產品和商標是“上海市名牌產品”和“上海市著名商標”，2013年開始被評為市企業誠信建設星級企業。 擁有自己的多種名貴藥材種養殖基地，同時在上海莘莊建設了現代化中藥飲片加工基地，基地在行業內率先通過了新版GMP認證。
上藥神象在全國擁有廣為覆蓋的終端營銷網絡和近200余家終端專柜和門店，積極拓展電子商務領域，在各大電商平臺設有旗艦店。 同時，在東方CJ、北京環球及浙、湘、贛、鄂和粵等電視購物頻道產品直銷， 使傳統滋補品搭上了新渠道快車。
上藥神象一貫重視品牌建設，致力于中醫藥傳統養生保健知識的傳播教育。新一代神象人把“致力于提高人們健康生活品質”為使命，立志“成為百姓信賴和尊敬的健康養生顧問”，將繼續以中醫藥理論為指導，把上藥神象打造成為國內領先的中藥保健品品牌企業！
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上海上藥雷允上醫藥有限公司是上海市藥材有限公司旗下全資子公司，公司始終堅持質量為本、服務為先的操守，實現社會價值和自我價值的持續升華。
公司擁有三萬多平方米倉儲面積的現代物流體系，配置冷鏈和智能管理等先進設施。以符合GSP規范的快捷、安全物流作業，構筑強大的藥品配送服務能力，為廣大客戶提供全方位優質服務。
公司經銷全國名特優新中成藥達1000余種；業務覆蓋上海市近700余家醫療機構和80多家主流批發企業，與國內300余家藥品供應商保持密切的合作關系。
雷允上醫藥建立醫院用藥預警監控系統、參與醫院藥房一體化建設、優化流通成本、推進大數據信息化建設，開發適合醫院個性化需求的物流管理服務延伸系統，引入條形碼、電子標簽等物流技術，真正實現公司與醫院的供應鏈一體化。
上海市藥材有限公司是上海市首批獲得自營進出口經營資格的企業之一，是上海中醫藥服務貿易試點單位。公司國際貿易部成立于1992年，主營中藥材、中成藥、保健食品、中藥加工檢測設備的進出口業務。主要出口中藥材、中成藥、保健食品到東南亞、北美和歐洲地區，代表性產品六神丸、傷濕止痛膏。專業進口海外產地道藥材，高麗參、西洋參、燕窩等名貴藥材，以及中藥加工和檢測設備。并承接中藥材、中成藥、保健食品的來方加工和定牌加工。
上海市藥材有限公司西紅花事業部專業負責西紅花（藏紅花）科研、種植、生產及銷售。事業部位于崇明生態島的西紅花培植核心產區，是國家食品藥品監督管理局的首批中藥材規范化種植（GAP）認證基地，擁有國內首家西紅花引種成功的技術經驗。目前，西紅花部對西紅花全產業實行嚴格的全程質量管理標準，是高品質西紅花的根本保證。
面對未來，西紅花部將進一步依托科研、種植、加工、銷售一體化的專業優勢，創新發展、專注領域，提供更多更好的西紅花產品和服務，以滿足大眾健康的不同需求。
國家種植標準化課題起草單位
2016年1月，上海市藥材有限公司成立中藥資源事業部，專注中藥材基地建設、中藥材種植的科技研發，建設成優質中藥材的生產者和供應商。
目前事業部已經營、研發丹參、銀杏葉、三七、人參等品種，在山東臨沂、遼寧本溪、湖南安化、四川都江堰、云南文山等地設有道地藥材的產地公司或基地，從產業鏈源頭出發，引入QBD理念，采取差異化栽培、走中藥生態農業的道路，不斷推進產品相關種植及質量標準的提升，確保中藥材質量的地道、優質和穩定。
上海市藥材有限公司依托作為上海中醫藥大學校董單位而擁有的中醫醫師整合資源，成立了專業專注終端醫療市場的中醫醫療事業部。擬通過中醫名家與企業優質品牌中藥、飲片，即“好醫+好藥”的結合，打造治療與養生并舉的健康服務新模式。
2016年，傾力打造的旗下首家中醫醫療機構——上海雷氏中醫門診部正式成立，以“醫—藥—養”三位一體的“全健康管理”方式，將“中醫治未病”及“大健康”理念充分融入到醫療服務之中，恪守“名醫用名藥，好藥治好病”的原則為老百姓提供“優質藥和精品藥”。
2017年，為進一步繼承和弘揚中醫藥，推廣中醫藥特色，更好地直接服務于百姓健康，旗下第二家中醫醫療機構——上海雷氏漢光中醫門診部正式對外試運營。
